Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fmn1Q05860 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fmn1Q05860 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms