Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sox9Q04887 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sox9Q04887 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sox9Q04887 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sox9Q04887 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sox9Q04887 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms