Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Msx2Q03358 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Msx2Q03358 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms