Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hivep1Q03172 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms