Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1sQ02789 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms