Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cacna1cQ01815 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms