Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelpQ01102 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelpQ01102 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms