Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde4dQ01063 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde4dQ01063 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde4dQ01063 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde4dQ01063 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde4dQ01063 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pde4dQ01063 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms