Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms