Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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