Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxb13P70321 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxb13P70321 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxb13P70321 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb13P70321 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxb13P70321 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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