Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms