Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms