Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp46P62069 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp46P62069 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp46P62069 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms