Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms