Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg6P61406 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg6P61406 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms