Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sem1P60897 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sem1P60897 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sem1P60897 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sem1P60897 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sem1P60897 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sem1P60897 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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