Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms