Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tubgcp3P58854 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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