Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CckbrP56481 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CckbrP56481 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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