Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irf5P56477 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms