Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcanP55066 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcanP55066 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcanP55066 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcanP55066 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcanP55066 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NcanP55066 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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