Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ephb3P54754 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ephb3P54754 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms