Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SftpbP50405 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SftpbP50405 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms