Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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