Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx2P48379 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms