Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf7P43029 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdf7P43029 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf7P43029 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms