Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clec3bP43025 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms