Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms