Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrbP28704 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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