Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col2a1P28481 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col2a1P28481 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms