Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms