Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms