Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RarbP22605 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RarbP22605 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RarbP22605 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RarbP22605 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RarbP22605 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms