Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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