Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pou5f1P20263 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms