Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms