Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sptan1P16546 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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