Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim30aP15533 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms