Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms