Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms