Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms