Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
P10404 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
P10404 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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P10404 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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P10404 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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P10404 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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P10404 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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P10404 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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