Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms