Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms