Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ndufb1P0DN34 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms