Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spta1P08032 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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