Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PdgfrbP05622 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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