Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01740 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01740 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01740 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms