Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01727 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01727 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01727 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms